قله پژوهشهای بین رشته ای دانشکده های فناوریهای نوین است، دانشکده فناوریهای نوین دانشگاه علوم پزشکی اصفهان دارای چندین هسته توانمند با هسته قلب و چشم با سابقه بوده و بهترین دپارتمان مهندسی بافت کشور نیز است، همچنین پرداختن به بحث بازیها برای حل مسائل بهداشت و سلامت اهمیت دارد که این هم نقطه روشن دیگری در این دانشکده است.