مجیدی پس از مذاکره با مدیران باشگاه استقلال، دوباره هدایت این تیم را بر عهده گرفت.
پس از محمود فکری، مدیران باشگاه استقلال فرهاد مجیدی را جایگزین وی کردند. فرهاد مجیدی فصل گذشته نیز هدایت آبی های پایتخت را عهده دار بود، اما پس از ناکامی در کسب عنوان جام حذفی از هدایت استقلال برکنار شد.
قرارداد مجیدی با استقلال به مدت ۲ سال و نیم است. استقلال اکنون با ۲۷ امتیاز در رده سوم جدول رده بندی قرار دارد.
استقلال در لیگ نوزدهم سراغ آندرهآ استراماچونی مربی نام آشنای ایتالیایی رفت و در شرایطی که تیم او شرایط بسیار خوبی به لحاظ فنی داشت، مربی ایتالیایی به دلایل مختلفی تصمیم به قطع همکاری با این تیم گرفت. بعد از تلاشهای بی حاصل مدیران استقلال برای بازگرداندن استرا، فرهاد مجیدی جانشین او شد. او در اواخر لیگ نوزدهم با احمد سعادتمند مدیرعامل وقت استقلال وارد یک جنگ تمام عیار شد و بعد از پیروزی مقابل پرسپولیس در دربی جام حذفی و در آستانه فینال این تورنمنت از سرمربیگری استقلال استعفا داد منتهی نهایتا در فینال جام حذفی هم روی نیمکت تیمش نشست و بعد از شکست به تراکتور، با شاگردانش خداحافظی کرد و به همکاریاش با استقلال خاتمه داد.
استقلال در لیگ قهرمانان آسیا از مجید نامجومطلق به عنوان سرمربیاش استفاده کرد. در شروع لیگ بیستم استقلالیها که انتخابهای زیادی برای سرمربیگری نداشتند با محمود فکری به توافق رسیدند که این مربی فقط ۱۶ هفته هدایت استقلال را به عهده داشت.
بنابراین استقلال در برهههای مختلف در این ۳ فصل ۶ مربی را به صورت موقت و دائمی روی نیمکت خود دیده است که مجیدی در دو مقطع مربی و سرمربی استقلال بوده و این یعنی استقلال در طی این چند فصل فقط روی موج تغییر بوده و دستاورد ارزشمندی هم کسب نکرده است.